Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ss18Q62280 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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