Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms