Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SnrpaQ62189 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SnrpaQ62189 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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