Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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