Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Odf1Q61999 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Odf1Q61999 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Odf1Q61999 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Odf1Q61999 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Odf1Q61999 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Odf1Q61999 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Odf1Q61999 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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