Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc9a1Q61165 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms