Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms