Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbbp7Q60973 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbbp7Q60973 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp7Q60973 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbbp7Q60973 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbbp7Q60973 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbbp7Q60973 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp7Q60973 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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