Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mkrn3Q60764 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Mkrn3Q60764 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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