Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk2a1Q60737 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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