Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd4Q60688 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd4Q60688 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms