Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CttnQ60598 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms