Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms