Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Spag9Q58A65 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spag9Q58A65 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms