Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim26Q3V460 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms