Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmprss12Q3V0Q7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms