Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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