Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms