Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms