Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cog7Q3UM29 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms