Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rmdn3Q3UJU9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms