Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm648Q3UJ22 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm648Q3UJ22 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm648Q3UJ22 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm648Q3UJ22 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms