Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LchnQ3UHG7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LchnQ3UHG7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms