Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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