Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Palb2Q3U0P1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms