Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms