Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam107bQ3TGF2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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