Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms