Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
StumQ0VBF8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
StumQ0VBF8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms