Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprgQ05909 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms