Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcad1Q04692 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smarcad1Q04692 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms