Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff2Q03404 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms