Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Runx1Q03347 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms