Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddr1Q03146 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddr1Q03146 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms