Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb5Q02739 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms