Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp1Q01514 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp1Q01514 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms