Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top2aQ01320 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top2aQ01320 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms