Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin2bQ01097 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2bQ01097 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms