Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde1bQ01065 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms