Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms