Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmmrQ00547 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms