Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thumpd3P97770 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms