Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitx2P97474 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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