Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lig3P97386 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms