Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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