Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H3f3aP84244 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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