Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arf1P84078 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Arf1P84078 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms