Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb13P70321 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hoxb13P70321 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms