Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SbdsP70122 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbdsP70122 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SbdsP70122 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms