Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms